珠海横琴新区地方税务局为广东省地方税务局直属机构，正处级，委托珠海市地方税务局管理。主要职责是：负责珠海横琴新区范围内地方税纳税人税务登记以及应纳地方税、费的征收管理和日常检查工作。

珠海横琴新区地方税务局设5个正科级内设机构：

一、办公室。负责文秘、行政后勤、机关财务、税费宣传等工作；负责人事管理、教育培训和党务、工青妇、思想政治工作；负责执法教育和廉政教育；承办检举、控告和申诉地方税务人员行政违纪和执法违法案件等。

负责人：郭黎明    办公联系电话：2601855

二、政策法规科。承担地方税收执法监督、检查工作；承担本局规范性文件的合法性审核工作；承办税务行政诉讼和行政复议；负责拟定各税、费的具体征收管理办法，指导征管业务等。

负责人：张惠冰      办公联系电话：2601810

三、收入核算信息科。负责组织实施区局税收征管综合工作；承担税收计划、会计、统计和税收分析工作；负责系统经费收支管理工作；负责组织实施区局信息化工作等。

负责人：杨振汉    办公联系电话：2601813

四、管理一科。负责辖区范围内重点税源的监控和服务工作；负责中高风险应对任务和纳税评估工作；负责受理税收违法案件的举报、查处工作，组织实施税收专项检查等。

负责人：陈再成    办公联系电话：2601823

五、管理二科。负责横琴新区地方各税、费的申报和征收工作；承担涉税票证管理、发票管理和涉税事项的备案工作；负责纳税辅导和纳税服务工作；负责日常基础管理和低风险应对工作等。

负责人：邱身聪    办公联系电话：2601802